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十种质谱仪的优缺点
| 质谱仪种类 | 简介 | 优点 | 缺点 |
| 四极杆质谱仪，QMS | QMS是最常见的质谱仪器，定量能力突出，在GC-MS中QMS占绝大多数。 | 结构简单、成本低；维护简单；SIM功能的定量能力强；是多数检测标准中采用的仪器设备。 | 无串极能力，定性能力不足；分辨力较低（单位分辨），存在同位素和其他m/z近似的离子干扰；速度慢；质量上限低（小于1200u）。 |
| 飞行时间质谱仪，TOFMS | TOFMS是速度最快的质谱仪，适合于LC-MS方面的应用。 | 分辨能力好，有助于定性和m/z近似离子的区别，能够很好的检测ESI电喷雾离子源产生多电荷离子；速度快，每秒2～100张高分辨全扫描（如50～2000u）谱图，适合于快速LC系统（如UPLC）；质量上限高（6000～10000u）。 | 无串极功能，限制了进一步的定性能力；售价高于QMS；较精密，需要认真维护。 |
| 三重四极杆质谱仪，QQQ | QQQ质谱给四极杆质谱仪在保留QMS原有定量能力强的特点上，提供了串级功能，加强了质谱的定性能力，检测标准中常作为QMS的确认检测手段。 | 有串极功能，定性能力强;定量能力非常好，MRM信噪比高于QMS的SIM；是常用的QMS结果确认仪器;除一般子离子扫描功能外，QQQ还具有SRM、MRM、母离子扫描、中性丢失（Neutral loss）等功能（离子阱不行）对特征基团的结构研究有很大帮助。 | 分辨力不足，容易受m/z近似的离子干扰;售价较高；需要认真维护。 |
| 四极离子阱，QTrap | 技术上而言，在传统QQQ的四极杆中加入了辅助射频，可以做选择性激发；或者就功能而言，为QQQ提供了多级串级的功能。 | 同时具备MRM、SRM、中性丢失和多级串级功能，非常适合于未知样品的结构解析。 | 分辨力低。 |
| 线性离子阱，Linear Ion Trap | 传统3D离子阱的增强版本。 | 相对于传统3D离子阱，灵敏度高10倍以上;多级串级质谱。 | 相对于QQQ，还是不能做MRM、中性丢失等特征基团筛选功能。 |
| 四极杆飞行时间串联质谱，QTOF | QTOF以QMS作为质量过滤器，以TOFMS作为质量分析器。 | 能够提供高分辨谱图；定性能力好于QQQ；速度快，适合于生命科学的大分子量复杂样品分析。 | 成本高；需要仔细维护。 |
| 离子阱-飞行时间质谱，Trap TOF | 以3D离子阱作为质量选择器和反应器，结合了离子阱的多级质谱能力和飞行时间质谱的高分辨能力。 | 同时具有多级串级和高分辨能力，适合于未知样品的定性工作，如糖蛋白的定性。 | 由于离子阱容量限制，对于混合样品的灵敏度欠佳；定量能力弱。 |
| 磁质谱，Sector MS | 磁质谱的定量能力是各种质谱中最强的。现在已较少使用，仅用于地质元素和痕量二恶英的检测。 | 技术经典、成熟，NIST等MS库采用的仪器；分辨力非常好（100k，m/&Delta m FWHM），干扰少；灵敏度高，定量能力是各种质谱中最好的。 | 体积、重量大；售价很高；速度慢；维护复杂，很费电。 |
| 傅立叶变换质谱仪，FT-ICR-MS | 傅立叶变换质谱仪的分辨能力最高，常作为高端科学研究的装备。 | 能够做多级串级，定性能力极好；分辨力极高；灵敏度很好。 | 体积重量大；售价极高；速度也较慢；维护费用非常昂贵。 |
| 静电场傅立叶变换质谱，Orbitrap | 高分辨，60k～120kFWHM，质量精度高；相对FT-ICR而言，价格稍低（～450kUSD）。 | 不能单独做串级；分辨力、灵敏度、质量稳定性等离FT-ICR还有距离。 |
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